Константин Северинов. Q&A к лекциям «Как клонируют ДНК — кошмар борцов с ГМО». Часть 2

Специалист в области молекулярной биологии, профессор Сколковского института науки и технологий, профессор Ратгерского университета (США) Константин Северинов проводит на моем канале курс лекций по молекулярной биологии. Два раза в месяц он отвечает на накопившиеся вопросы.

С нами студенты субботней школы Северинова:

— Василий Рига
— Екатерина Архипова

00:00 Начало. Татьяна Фельгенгауэр
00:28 Вступление. Оргвопросы
03:18 Студенты о себе
07:23 Вопросы «за жизнь». Какие эксперименты можно делать в домашних условиях?
10:25 Земля микробов
11:07 Северный морской путь
11:36 Научно-исследовательское судно «Академик Иоффе»
11:54 Проект гражданской науки
12:55 Обучение в школе
14:04 Клонирование
15:35 Как понять порядок соединение в исходной молекуле?
16:03 Рестрикционное картирование
20:10 Почему на реальных фото электрофореза полоски скорее похожи на скобки?
22:42 Насколько тяжело добиться красивой картинки?
24:08 Как перед трансформацией отбраковываются лишние молекулы?
25:43 Плазмида, чужеродное ДНК, клетки кишечной палочки
26:39 Как экспериментировать с содержимым клетки? Например плазмидами?
28:27 Почему клетки на чашке Петри одинаковые? Почему там не могут быть смеси разных клеток?
31:24 Как делается опыт с переносом одной чашки на две отдельные с разными антибиотиками?
34:10 Зубочистка
34:24 «Поднимальщик колоний»
38:44 Как после чашки Петри отожгли ДНК в колониях прямо на фильтрованой бумаге и соединили её с радиоактивно-меченными участками?
39:08 Идентификация гена интереса с помощью гибридизации ДНК в колониях бактерий?
43:08 Гибридизация колоний
48:40 Аденовирус не встраивается в клетки?
51:39 Почему после обработки рестриктазой мы видим только полоски от получившихся фрагментов, не видя полоски от оригинальной большой молекулы?
52:15 Частичный перевар (недовар)
53:42 Как планируется ДНК хозяина на нужные части если видов ножниц не так много?
54:04 Ферменты для молекулярного клонирования
55:13 Мы не можем резать где угодно, а только на узнаваемых нам участках?
56:34 Каким образом из куска в 4000 мы можем точно вычленить очень нужные 63 буквы?
57:51 Направленные делеции
1:02:07 Почему нельзя химически синтезировать нужную последовательность ДНК?
1:03:44 Зачем столько мучений по выделению нужного гена из ДНК? Если цепочку нуклеотидов можно синтезировать?
1:04:42 Как проверяют нет ли опасных мутаций в выделенных человеческих последовательностях прежде чем внедрить их в плазмиду?
1:05:33 Подтверждение правильности клонированной вставки «шаганием праймером»
1:08:26 Можно ли геном человека нарезать ломтиками а потом снова собрать в человека как шкафчик из икеа?
1:09:55 Молекулярное клонирование
1:10:44 Сколько должно быть клонов в библиотеке чтобы там содержался весь геном человека?
1:13:18 Может ли аденовирус научиться встраиваться, если он модифицированный и может чуть больше чем обычно?
1:14:07 Как делают нужные праймеры для ПЦР?
1:15:06 Что в первую очередь запускает алгоритм старения нашего организма?
1:15:20 Можно ли печатать живые вирусы для лечения? Или это пока недоступно?
1:16:02 Если убрать мусорную ДНК то можно будет собрать?
1:17:32 Может ли мутация бактерий под воздействием антибиотиков повлиять на вставку плазмиды?
1:18:19 Дешевеют ли пипеточные работы чтобы полностью в будущем исключить человеческий фактор?
1:21:09 Рестрикция/Модификация; Эпигенетика
1:35:20 Заражение лаборатории ФАГом
1:36:43 Рестриктаза имеет определённый сайт узнавания, не значит ли это что наличие сайтов рестрикций накладывает ограничение на последовательность аминокислот в белках?
1:40:12 EcoR5 родственна EcoR1?
1:41:50 Структура рестриктазы
1:45:17 Почему после размножения в клетке Ц вирус получается без шариков?
1:46:33 «Защита» метилирование РНК
1:50:14 У нас в клетках точно также рестриктазы вируса «кусают» как в бактериях?
1:51:11 Представим что Вы клетка
1:53:10 При кроссинговере ДНК обмениваются фрагментами тоже при помощи рестриктаз и лигаз?
1:53:26 DSB repair
1:55:12 Разнообразие рестриктаз, все ли они узнают сайты из 6 оснований?
1:57:55 Все белки начинаются с метионина, значит всё таки это не первые аминокислоты инсулина?
1:59:15 Алик Варшавский и его правило
2:01:31 Две пептидные цепи инсулина соединяют химически?
2:03:20 «Утверждение «трансляция начинается с ближайшего к 5′ концу mPHK AUG» справедливо»?
2:04:34 Кроссинговер между половыми хромосомами у мужчин
2:09:04 Оргвопросы/благодарности

Все лекции — https://youtube.com/playlist?list=PLZVQqcKxEn_4vjM5OgDpRSLlsoIVu7s6n
Презентации лекций — https://drive.google.com/drive/folders/1GJRO4jHTC7ulAYIEYm2RynQuNkNqeLaX?usp=sharing

Стать патроном — https://www.patreon.com/plushev
Оформление — http://vlso.ru

Каналы соратников:
Майкл Наки — наш совместный стрим и грандиозные ролики — https://www.youtube.com/channel/UCgpSieplNxXxLXYAzJLLpng
«Кек и Символ» Тани Фельгенгауэр — https://www.youtube.com/channel/UC0OiowQ-fTqw3Kq3bfopO_Q

#Северинов #Плющев #молекулярнаябиология